Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SynaQ5G5D5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SynaQ5G5D5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SynaQ5G5D5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SynaQ5G5D5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SynaQ5G5D5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SynaQ5G5D5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms