Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms