Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms