Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sfmbt2Q5DTW2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms