Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chsy3Q5DTK1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chsy3Q5DTK1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chsy3Q5DTK1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chsy3Q5DTK1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chsy3Q5DTK1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chsy3Q5DTK1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chsy3Q5DTK1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chsy3Q5DTK1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Chsy3Q5DTK1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chsy3Q5DTK1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chsy3Q5DTK1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chsy3Q5DTK1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chsy3Q5DTK1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chsy3Q5DTK1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chsy3Q5DTK1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chsy3Q5DTK1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chsy3Q5DTK1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chsy3Q5DTK1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chsy3Q5DTK1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chsy3Q5DTK1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Chsy3Q5DTK1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Chsy3Q5DTK1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Chsy3Q5DTK1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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