Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms