Protein–RNA interactions for Protein: Q505D1

Ankrd28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28Q505D1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ankrd28Q505D1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms