Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms