Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms