Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms