Protein–RNA interactions for Protein: Q4FJU9

Tmem40, Transmembrane protein 40, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem40Q4FJU9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tmem40Q4FJU9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tmem40Q4FJU9 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tmem40Q4FJU9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Tmem40Q4FJU9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Tmem40Q4FJU9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Tmem40Q4FJU9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Tmem40Q4FJU9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem40Q4FJU9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem40Q4FJU9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem40Q4FJU9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem40Q4FJU9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem40Q4FJU9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem40Q4FJU9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem40Q4FJU9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem40Q4FJU9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem40Q4FJU9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem40Q4FJU9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem40Q4FJU9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem40Q4FJU9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem40Q4FJU9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem40Q4FJU9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem40Q4FJU9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem40Q4FJU9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem40Q4FJU9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem40Q4FJU9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem40Q4FJU9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem40Q4FJU9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem40Q4FJU9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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