Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Brinp3Q499E0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms