Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms