Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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