Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYK3

Tbc1d9, TBC1 domain family member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d9Q3UYK3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d9Q3UYK3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d9Q3UYK3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d9Q3UYK3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d9Q3UYK3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d9Q3UYK3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d9Q3UYK3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d9Q3UYK3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d9Q3UYK3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d9Q3UYK3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d9Q3UYK3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d9Q3UYK3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d9Q3UYK3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9Q3UYK3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms