Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc114Q3UX62 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc114Q3UX62 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc114Q3UX62 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc114Q3UX62 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc114Q3UX62 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc114Q3UX62 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc114Q3UX62 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc114Q3UX62 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc114Q3UX62 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc114Q3UX62 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc114Q3UX62 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc114Q3UX62 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc114Q3UX62 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc114Q3UX62 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc114Q3UX62 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc114Q3UX62 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms