Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clca4bQ3UW98 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clca4bQ3UW98 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clca4bQ3UW98 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clca4bQ3UW98 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clca4bQ3UW98 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clca4bQ3UW98 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clca4bQ3UW98 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clca4bQ3UW98 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clca4bQ3UW98 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clca4bQ3UW98 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clca4bQ3UW98 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clca4bQ3UW98 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clca4bQ3UW98 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clca4bQ3UW98 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clca4bQ3UW98 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clca4bQ3UW98 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clca4bQ3UW98 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Clca4bQ3UW98 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clca4bQ3UW98 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clca4bQ3UW98 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clca4bQ3UW98 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clca4bQ3UW98 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clca4bQ3UW98 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clca4bQ3UW98 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clca4bQ3UW98 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clca4bQ3UW98 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clca4bQ3UW98 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clca4bQ3UW98 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clca4bQ3UW98 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clca4bQ3UW98 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms