Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW22

Defb48, Beta-defensin 42, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb48Q3UW22 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Defb48Q3UW22 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defb48Q3UW22 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defb48Q3UW22 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defb48Q3UW22 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defb48Q3UW22 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defb48Q3UW22 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defb48Q3UW22 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defb48Q3UW22 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defb48Q3UW22 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defb48Q3UW22 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms