Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms