Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms