Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
B230104I21RikQ3USW4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms