Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Gm6899Q3USS0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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