Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3UPC7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q3UPC7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3UPC7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3UPC7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3UPC7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3UPC7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3UPC7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3UPC7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3UPC7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3UPC7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3UPC7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3UPC7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3UPC7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3UPC7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3UPC7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3UPC7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3UPC7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3UPC7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3UPC7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3UPC7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3UPC7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3UPC7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3UPC7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3UPC7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3UPC7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3UPC7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3UPC7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3UPC7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3UPC7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3UPC7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3UPC7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms