Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms