Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp19Q3UJD6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms