Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms