Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmed8Q3UHI4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmed8Q3UHI4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmed8Q3UHI4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmed8Q3UHI4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmed8Q3UHI4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmed8Q3UHI4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmed8Q3UHI4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmed8Q3UHI4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed8Q3UHI4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed8Q3UHI4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed8Q3UHI4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed8Q3UHI4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed8Q3UHI4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed8Q3UHI4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed8Q3UHI4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed8Q3UHI4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed8Q3UHI4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed8Q3UHI4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed8Q3UHI4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed8Q3UHI4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed8Q3UHI4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed8Q3UHI4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed8Q3UHI4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmed8Q3UHI4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmed8Q3UHI4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmed8Q3UHI4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms