Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms