Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEI1

Pde4c, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4cQ3UEI1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde4cQ3UEI1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pde4cQ3UEI1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms