Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms