Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms