Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U595 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U595 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U595 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U595 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U595 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U595 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U595 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U595 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U595 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U595 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U595 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U595 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U595 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U595 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U595 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U595 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U595 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U595 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U595 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U595 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U595 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U595 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U595 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U595 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U595 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U595 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U595 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U595 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U595 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U595 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U595 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U595 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U595 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U595 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U595 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U595 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U595 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U595 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U595 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U595 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U595 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U595 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U595 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U595 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U595 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U595 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U595 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U595 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U595 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U595 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U595 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U595 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U595 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U595 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U595 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U595 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U595 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U595 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U595 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U595 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U595 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U595 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U595 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U595 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U595 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U595 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U595 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U595 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U595 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U595 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U595 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U595 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U595 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U595 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U595 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U595 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U595 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U595 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U595 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U595 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U595 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U595 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U595 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U595 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U595 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U595 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U595 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U595 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U595 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U595 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U595 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U595 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U595 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U595 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U595 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U595 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U595 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U595 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U595 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms