Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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