Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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