Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms