Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms