Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTL0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTL0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTL0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TTL0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TTL0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TTL0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TTL0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TTL0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TTL0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TTL0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms