Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms