Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp444Q3TDV8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms