Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms