Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem248Q3TBN1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem248Q3TBN1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms