Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd8Q3TA59 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd8Q3TA59 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd8Q3TA59 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd8Q3TA59 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd8Q3TA59 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd8Q3TA59 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd8Q3TA59 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd8Q3TA59 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd8Q3TA59 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd8Q3TA59 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd8Q3TA59 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd8Q3TA59 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Jmjd8Q3TA59 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms