Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riiad1Q3KNY5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms