Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cers3Q1A3B0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms