Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptcd3Q14C51 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptcd3Q14C51 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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