Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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ptchd1Q14B62 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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ptchd1Q14B62 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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