Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms