Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Perm1Q149B8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Perm1Q149B8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Perm1Q149B8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Perm1Q149B8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Perm1Q149B8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Perm1Q149B8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms