Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VgfQ0VGU4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VgfQ0VGU4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms