Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp4r2Q0VGB7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp4r2Q0VGB7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp4r2Q0VGB7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp4r2Q0VGB7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp4r2Q0VGB7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp4r2Q0VGB7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp4r2Q0VGB7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp4r2Q0VGB7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp4r2Q0VGB7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp4r2Q0VGB7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp4r2Q0VGB7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp4r2Q0VGB7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp4r2Q0VGB7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp4r2Q0VGB7 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp4r2Q0VGB7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp4r2Q0VGB7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp4r2Q0VGB7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp4r2Q0VGB7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp4r2Q0VGB7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp4r2Q0VGB7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp4r2Q0VGB7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ppp4r2Q0VGB7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms